MIT 3 – Brak prawa do odliczenia VAT z faktury spoza KSeF

„Nie będę miał prawa do odliczenia VAT z faktury wystawionej poza KSeF wbrew obowiązkowi ciążącemu na sprzedawcy.”

Częstym źródłem nieporozumień dotyczących wdrożenia obowiązkowego korzystania z KSeF jest kwestia powiązania prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego z wystawieniem faktury w systemie. Podatnicy obawiają się, że utracą prawo do odliczenia podatku VAT wynikającego z faktury wystawionej przez sprzedawcę poza systemem, wbrew obowiązkowi.

Prawo do odliczenia przysługuje

Obawy te nie są jednak zasadne – podatnicy zachowają prawo do odliczenia, nawet jeśli sprzedawca wystawi fakturę poza KSeF, mimo ciążącego na nim obowiązku. Takie stanowisko komunikowane jest przez Ministerstwo Finansów w związku z pracami nad wdrożeniem systemu, a także znalazło potwierdzenie w interpretacjach indywidualnych wydawanych przez Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej[1].

Sądy i TSUE na straży prawa do odliczenia

Co więcej, odmowa prawa do odliczenia podatku VAT z powodu naruszenia wymagań formalnych (jak np. obowiązek wystawienia faktury w KSeF), pomimo spełnienia warunków materialnych dla skorzystania z tego prawa, mogłaby zostać uznana za naruszenie zasady neutralności, będącej fundamentalną zasadą wspólnego systemu VAT. Podobne rozważania były wielokrotnie przedmiotem orzeczeń Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej[2], jak i polskich sądów administracyjnych[3].

Weryfikacja obowiązku KSeF sprzedawcy – trudna w praktyce

Również z praktycznego punktu widzenia nabywca nie zawsze będzie miał środki umożliwiające zweryfikowanie, czy na sprzedawcy ciążył obowiązek wystawienia faktury w KSeF. Przykładowo, w przypadku zagranicznych podmiotów zarejestrowanych w Polsce dla potrzeb podatku VAT, obowiązek wystawiania faktury w KSeF uzależniony będzie od posiadania w Polsce stałego miejsca prowadzenia działalności gospodarczej, które zostało wykorzystane na potrzeby danej transakcji. Trudno oczekiwać, aby nabywca analizował takie okoliczności.

Podsumowanie

Reasumując, jeżeli faktura otrzymana przez podatnika dokumentuje rzeczywisty przebieg zdarzeń gospodarczych i spełnione zostały materialne przesłanki prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego, to nabywcy będzie przysługiwało prawo do odliczenia, nawet jeżeli sprzedawca wystawił fakturę poza KSeF pomimo ciążącego na nim obowiązku.

______________________

[1] Interpretacja DKIS z 13 października 2025 r. sygn. 0113-KDIPT1-3.4012.833.2025.2.ALN; Interpretacja DKIS z 20 października 2025 r. sygn. 0114-KDIP1-3.4012.739.2025.1.AMA; Interpretacja DKIS z 18 listopada 2025 r. sygn. 0112-KDIL1-3.4012.722.2025.1.MR

[2]  np. wyrok TSUE z 15 lipca 2010 r. w sprawie C‑368/09 Pannon Gép Centrum kft przeciwko APEH Központi Hivatal Hatósági Főosztály Dél‑dunántúli Kihelyezett Hatósági Osztály,

[3] np. Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 29 października 2021 r., sygn. I FSK 1656/21