Sukces w kontroli celno-skarbowej – wsparcie dla międzynarodowej spółki stoczniowej

Eksperci MDDP zapewnili pełne wsparcie klientowi – spółce z branży stoczniowej – w toku kontroli celno-skarbowej dotyczącej rozliczenia CIT za 2020 r. Spółka odnotowywała straty, co zwróciło uwagę organu, który w ramach kontroli podatkowej skupił się wyłącznie na tematyce cen transferowych.

Sytuacja klienta

Kontrolujący zażądali wyjaśnień w zakresie straty odnotowanej na głównej działalności – sprzedaży maszyn na rzecz spółki matki w Danii. Kluczowe było wskazanie rynkowości przyjętego modelu cen transferowych w kontekście międzynarodowej strategii grupy.

Nasze działania

Pracami zespołu doradczego kierowała Magdalena Marciniak – partner, doradca podatkowy, szefowa zespołu cen transferowych we współpracy z Martą Klepacz – partnerem oraz ekspertką z zakresu cen transferowych.

Kompleksowa analiza przeprowadzona przez ekspertów MDDP na potrzeby kontroli celno-skarbowej dotyczącej rozliczenia CIT za 2020 rok uwzględniała wszystkie kluczowe aspekty działalności spółki:

strukturę danych finansowych spółki na przestrzeni lat,
dokumentację cen transferowych – lokalną oraz przygotowywaną przez grupę,
analizę cen transferowych – odzwierciedlającą rzeczywisty charakter transakcji,
strategię biznesową realizowaną przez polski podmiot i jego spółkę matkę,
uwarunkowania na rynku i horyzont czasowy realizacji nowych inwestycji w branży stoczniowej (2020 r. był jednym z pierwszych lat działalności spółki w nowej odsłonie),
zmianę profilu funkcjonalnego spółki po przejęciu innego podmiotu, co było istotne pod kątem strategii rozwoju i związanych z tym wyników finansowych, w tym podatkowych,
czynniki nadzwyczajne występujące w 2020 r.

Przedstawiona organowi argumentacja biznesowa uwzględniała wskazane obszary i podkreślała międzynarodową perspektywę działalności grupy. Eksperci MDDP przedstawili uzasadnienie przyjętego przez spółkę modelu cen transferowych oraz, w toku rozmów z organem, wypracowali podejście pozwalające odpowiednio zaadresować występujące odchylenia.

Efekty naszej pracy

Dzięki prowadzonym negocjacjom organ podatkowy zaakceptował przedstawione argumenty i wyniki analizy porównawczej. W konsekwencji, przy wsparciu ekspertów MDDP, spółka obroniła rynkowy charakter rozliczeń i uniknęła doszacowania dochodu w wysokości około 2,5 mln zł.

Kontrole celno-skarbowe

Jest to szczególnie istotny temat, ponieważ najnowsza, II edycja raportu MDDP przygotowana we współpracy z Konfederacją Lewiatan „Przedsiębiorcy pod lupą fiskusa” pokazuje, że działania organów podatkowych coraz częściej przybierają formę bieżącego monitorowania rozliczeń. W 2025 r. przeprowadzono niemal 2,3 mln czynności sprawdzających, a wartość wykrytych w ich ramach uszczupleń sięgnęła blisko 11 mld zł. Choć liczba kontroli podatkowych i celno-skarbowych spada, ich skuteczność pozostaje bardzo wysoka – nieprawidłowości stwierdzano w 95,5% kontroli podatkowych i 90% kontroli celno-skarbowych. Szczególne znaczenie mają kontrole celno-skarbowe, które przyniosły prawie 6,5 mld zł zaległości, przy średnim ustaleniu na poziomie niemal 1,4 mln zł na kontrolę. To pokazuje, że dla przedsiębiorców każda kontrola może oznaczać istotne ryzyko finansowe.

Dowiedz się #WIĘCEJ >> Raport – Przedsiębiorcy pod lupą fiskusa 2026 | MDDP

Jak przygotować się do kontroli?

Dobre przygotowanie do kontroli podatkowej obejmuje przegląd procesów, dokumentacji i zgodności rozliczeń z przepisami, a także wsparcia specjalistów, którzy potrafią odpowiednio ocenić ryzyka i przygotować argumentację. Pozwala to ograniczyć ryzyko oraz sprawniej przejść przez samą kontrolę. Co warto zrobić?

1. Identyfikacja ryzyka podatkowego

Analiza obszarów działalności firmy, które mogą budzić wątpliwości w kontekście przepisów podatkowych, takie jak VAT, CIT, WHT, ceny transferowe czy ulgi podatkowe.
Skupienie na kwestiach, które mogą być szczególnie kontrolowane, takich jak m.in. fakturowanie, procedury VAT, rozliczenia transakcji międzynarodowych, wartości niematerialne,

2. Dokumentacja i przygotowanie

Weryfikacja, czy cała dokumentacja podatkowa i księgowa (m.in. faktury, umowy, ewidencje VAT, deklaracje podatkowe, raporty finansowe) jest kompletna i zgodna z obowiązującymi przepisami.
Weryfikacja, czy wszystkie sprawozdania finansowe i deklaracje podatkowe zostały złożone na czas.
W przypadku jakichkolwiek nieścisłości, złożenie korekty deklaracji VAT lub CIT.

3. Sprawdzenie zgodności z przepisami

Audyt podatkowy (np. kontrola VAT, weryfikacja poprawności rozliczeń TP, dokumentacji oraz TPR) w celu zidentyfikowania potencjalnych nieprawidłowości zanim w firmie pojawi się kontrola.
Weryfikacja z doradcą podatkowym wątpliwości co do stosowanych rozliczeń i procedur.

4. Przygotowanie odpowiedzi na zapytania

Przygotowanie wyjaśnień i dokumentów dla kwestii podatkowych wymagających odpowiedzi w toku kontroli.

5. Przygotowanie stanowisk w sprawach spornych

Przygotowanie do dyskusji o interpretacji przepisów oraz zabezpieczenie argumentacji, np. w formie opinii prawnych lub interpretacji podatkowych, na wypadek sporu.

6. Monitorowanie postępu kontroli

Weryfikacja, że wszystkie wymogi formalne są spełnione, np. termin dostarczenia dokumentów, termin odpowiedzi na pisma kontrolne.

7. Protokół z kontroli

Po zakończeniu kontroli organ skarbowy przygotuje protokół z kontroli, który będzie zawierał uwagi i ewentualne zastrzeżenia do rozliczeń podatkowych. Jeśli w protokole pojawią się błędy lub nierzetelne informacje, należy zgłosić zastrzeżenia w terminie wskazanym przez organ skarbowy (zwykle jest to 7 dni od otrzymania protokołu).

8. Przygotowanie do ewentualnych konsekwencji

W przypadku stwierdzenia nieprawidłowości organ może nałożyć dodatkowe zobowiązania, odsetki lub kary. Warto wtedy skonsultować się z doradcą podatkowym i przygotować strategię obrony.
W sytuacji, gdy decyzja organu skarbowego jest niekorzystna, istnieje możliwość odwołania się do wyższej instancji (np. do dyrektora izby skarbowej).

9. Zakończenie kontroli i działania po kontroli

Wypełnienie zaleceń i wprowadzenie korekt w dokumentacji.
Wdrożenie procedur minimalizujących ryzyka na przyszłość, np. poprzez poprawę kontroli wewnętrznych, szkolenie pracowników czy aktualizację procedur podatkowych.

Najczęstsze ryzyka w zakresie cen transferowych

Ceny transferowe to obszar, który pozostaje pod szczególną uwagą organów podatkowych. Błędy w tym zakresie mogą skutkować wielomilionowymi doszacowaniami podatku CIT/PIT oraz dodatkowymi sankcjami karno-skarbowymi. Do najczęstszych ryzyk należą nieprawidłowe ustalenie warunków transakcji między podmiotami powiązanymi, niespójność pomiędzy dokumentacją a rzeczywistym przebiegiem transakcji, stosowanie nierynkowych warunków transakcji np. w zakresie usług, finansowania lub licencji, a także brak rzetelnych analiz porównawczych potwierdzających rynkowy charakter rozliczeń.

Istotnym sygnałem ryzyka są również powtarzające się straty wykazywane przez podmioty powiązane, które mogą wzbudzać zainteresowanie organów podatkowych i prowadzić do weryfikacji, czy nie dochodzi do transferu dochodów poza Polskę. Ryzyko może wynikać także ze zmian modelu biznesowego grupy, niewłaściwego przypisania funkcji, aktywów i ryzyk poszczególnym podmiotom oraz braku regularnego przeglądu polityki cen transferowych.

Dodatkowo Ministerstwo Finansów konsekwentnie rozwija narzędzia analityczne służące wykrywaniu nieprawidłowości, wykorzystując m.in. dane z KSeF, JPK_CIT oraz innych obowiązków sprawozdawczych. W efekcie nawet pozornie niewielkie nieścisłości w dokumentacji lub rozliczeniach mogą stać się przedmiotem kontroli i prowadzić do długotrwałego sporu z organami podatkowymi.

Jakie są sankcje za błędy w dokumentacji cen transferowych?

Sankcje w obszarze cen transferowych są dotkliwe i dotyczą zarówno spółki, jak i osób odpowiedzialnych za realizację obowiązków dokumentacyjnych. Przepisy przewidują dwa główne rodzaje sankcji:

podatkowe, nakładane na spółkę w formie dodatkowego zobowiązania podatkowego,
karno-skarbowe, które obciążają osoby fizyczne – członków zarządu, dyrektorów finansowych czy głównych księgowych.

W przypadku doszacowania dochodu lub zakwestionowania straty, dodatkowe zobowiązanie podatkowe wynosi 10%, 20% lub 30% podstawy, w zależności od kompletności dokumentacji i wartości transakcji (próg 15 mln zł). Osobista odpowiedzialność wynika z Kodeksu Karnego Skarbowego – za brak dokumentacji, nieterminowe złożenie TPR lub podanie nieprawdziwych danych grozi grzywna do 720 stawek dziennych, które w 2026 r. wynoszą od 160,20 do 64 080 zł, co oznacza potencjalne kary sięgające kilkudziesięciu milionów złotych. Co istotne, odpowiedzialność nie ogranicza się do zarządu – może objąć każdą osobę zajmującą się sprawami finansowymi spółki, a nawet kierownika jednostki za brak nadzoru.

Doświadczenie MDDP w sektorze stoczniowym

Firma posiada szerokie doświadczenie we współpracy z podmiotami z sektora stoczniowego, realizując projekty doradcze na różnych etapach działalności stoczni i firm powiązanych. Doświadczenie obejmuje współpracę z wiodącymi stoczniami remontowymi i produkcyjnymi, w tym w zakresie wsparcia w obszarze prawa podatkowego oraz doradztwa w kwestiach związanych z regulacjami branżowymi. Zajmowaliśmy się m.in. doradztwem dotyczącym umów i kontraktów w zakresie budowy jednostek pływających, wsparciem przy restrukturyzacjach oraz wdrażaniem rozwiązań zgodnych z obowiązującymi normami unijnymi i krajowymi. Firmy te skorzystały z usług w zakresie analizy ryzyka podatkowego, w tym przy transakcjach z zagranicznymi podmiotami oraz kwestiach dotyczących obrotu statkami i ich komponentami.

Zespół cen transferowych MDDP

Zespół cen transferowych MDDP należy do największych i najbardziej doświadczonych w Polsce. Specjalizuje się w kompleksowym doradztwie w zakresie cen transferowych, wspierając klientów w przygotowaniu dokumentacji i analiz benchmarkingowych, projektowaniu polityki cen transferowych, zarządzaniu ryzykiem podatkowym oraz wdrażaniu procedur zgodnych z wytycznymi OECD.

#Więcej informacji o zespole >> Ceny transferowe (transfer pricing) | MDDP

Zespół postępowań podatkowych MDDP

Zespół Postępowań MDDP prowadzi sprawy na wszystkich etapach – od próby ugodowego zakończenia sporu, poprzez doradztwo w zakresie gromadzenia i oceny dowodów, aż po reprezentację przed sądami administracyjnymi i egzekucję należności, a także doradztwo w sprawach karnych skarbowych. Istotnym elementem pracy zespołu jest przygotowanie przedsiębiorców do kontroli – od analizy ryzyka i weryfikacji dokumentacji, przez wdrożenie procedur i instrukcji, po szkolenia dla pracowników.

#Więcej informacji o zespole >> Postępowania podatkowe | MDDP

Czy Twoja firma potrzebuje wsparcia w trakcie kontroli celno-skarbowej? Skontaktuj się z nami: